Zbirke muzeja Darwin, pa tudi samega muzeja, ne bi mogle nikoli obstajati, če ne bi bilo Aleksandra Fedoroviča Kotsa, ki je že od otroštva naklonjen zoologiji, nabiranju in izjemnemu zanimanju za vse živo. Kot biolog je v starosti 19 let (1899) odšel v Sibirijo, kjer je na razstavi enega od ruskih društev zbral zbirko polnjenih ptic, ki so mu prinesle medaljo.
Nadalje je mladenič sodeloval s slavnim taksidermistom F. Lorenzom, kjer je prejemal plačo z istimi nagačenimi živalmi (ki so bila osnova domače zbirke), študiral na univerzi, obiskal tuje muzeje, kjer se je seznanil z Darwinovo teorijo, predaval anatomijo na Višjih ženskih tečajih v Moskvi, v prostore katerih se je preselila zasebna zbirka (1907). Do leta 1964 je bil A. Cots stalni direktor skupščine, ki je preživela revolucije in vojne, šele leta 1995 je bil muzeju Darwin na ul. Dodeljen vreden prostor. Vavilova (hiša 57).
Danes razstave in razstave potekajo v glavni stavbi in v stavbi razstavnega kompleksa. Ločeno opremljene sobe za obiskovalce z okvarjenimi motornimi aparati, za gluhe, naglušne, slabovidne in slepe; so klančine, dvigala in dvigala, zaradi česar je obisk prijeten in udoben za vse kategorije občanov. Paleontološki muzej Darwin svojim gostom ponuja obsežne in zanimive programe, vključno s predstavami ustvarjalnih skupin, ogledi v dvoranah z opremo, ki reproducira glasove ptic, prikaz gibljivih modelov dinozavrov, prikaz, kako življenje vre v podvodnih vulkanih itd.
Mladi obiskovalci muzeja Darwin se lahko vpišejo na tečaje mladih biologov ali obiskujejo umetniške ateljeje in mojstrske tečaje, poleg tega pa lahko muzej kupi naročnine za udeležbo na programih, tudi v različnih kulturnih ustanovah v Moskvi. Za starejše otroke so lahko zanimivi video izleti na teme starodavnih ptic, evolucije, prazgodovinskih svetov, tudi v 3D obliki. V dvoranah zoogeografije lahko vidite izjemno usmrčene polnjene živali iz različnih delov planeta, predstavljene v okraskih, podobnih njihovemu naravnemu habitatu. Na stenah so vzorci živalskega krzna, ki jih je mogoče božati. V razstavi mikroevolucije lahko na interaktivni napravi poskusite "zbrati" ptico iz različnih delov, ki bo zapela njegovo pesem, če je naloga pravilno opravljena.
Dokaj pogosto se vrata muzeja Darwin za obiskovalce odprejo brezplačno. Praviloma se to zgodi med novoletnimi prazniki ali ob dneh, ko lahko obiščete posamezne razstave. Svetlobno-glasbena predstava "Živi planet" je na primer na voljo ob koncih tedna, turneja "Raznolikost življenja" pa ob torkih - petkih od 16. ure, pa tudi med vikendi in med počitnicami ob 12.00 in 16.30.
Zoološki muzej Darwin v Moskvi ima počitnice, posvečene temu ali onemu dogodku, vključno z: Dan družine, Dan Zemlje, Ptičji dan, Dan mladega ekologa, Materinski dan ali celo Leši dan (etnični praznik). Možno je obiskati muzej tudi ponoči (18. maja) ali naročiti rojstnodnevno zabavo za skupino otrok (vključuje obsežen izlet in pitje čaja v otroški sobi). Na tak dogodek so lahko vabljeni tako otroci (do 16 let) kot otroci z odraslimi (skupine, ki ne presegajo 20–35 ljudi).
